이온쌍 AG와 BG의 분포 계수는 유리 산이나 유리 염기의 분포 계수와 다르기 때문에 혼합물 속에 nonionogenic 성분은 영향을 받지 않는 반면, ionogenic 화합물의 보전 양상은 유의적으로 변한다. 이온쌍의 형성은 산과 염기 성분, 그리고 반대 이온과 이온쌍을 생성하는 화합물의 해리 평형으로 결정된다. 고정상이나 이동상의 pH에서의 변화는 이온쌍 해리에 영향을 줄 수 있다. 그러므로 체계는 흥미있는 물질의 분리에 선택적으로 최적화된다. 최적 분리를 위한 pH 조절을 위해 반대 이온을 생성하는 화합물은 넓은 pH 범위, 예를 들어 강한 산(과염소산 또는 알킬술폰산)이나 강한 염기의 염(4차 암모늄염)에서 해리되어야 한다. 버퍼 용액은 2와 8 사이에서 선택된 값으로 pH 상수를 유지하는 데 사용된다.