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제목
[Proteomics] MALDI 매트릭스 선정 조건 및 자주 사용되는 표준 단백질과 분자량 -
작성자
이매스 -
첨부파일
전자분무 방식과는 다르게 매트릭스상 레이저 탈리 이온화를 통한 효율적인 단백질 및 펩티드 질량분석을 위해서 매트릭스는 다음과 같은 조건으로 갖추어야한다.
1. 매트릭스 화학물과 단백질의 공동 결정화를 통하여 쉽게 분리가 가능해야한다.
2. 단백질과 친화도가 높은 용매에 잘 용해 되어야 한다.
3. 진공 상태에서 승화 등에 의하여 증발되지 않고 결정 형태를 유지할 수 있어야 한다.
4. 레이저광을 잘 흡수할 수 있는 발색단(chromophore)을 가지고 있어야 한다.
5. 레이저광 에너지로 인하여 쉽게 탈리 이온화 되어야한다.
6. 분석 시료 단백질의 이온화를 도울 수 있어야한다.
매트릭스와 단백질 시료와의 적절한 혼합비는 약 5000:1 정도가 바람직하며, 분석이 가능한 최종 단백질 농도는 약 1~10pmol/ul가 된다. 따라서 단백질 샘플 시료는 최소한 이 농도 범위 이상을 얻어야 됨을 알 수 있다. 다음은 일반적으로 사용되는 단백질 분석용 표준 시료와 분자량에 대한 정보이다.
MALDI 질량분석에서 자주 사용되는 표준 단백질과 분자량
1) Angiotensin ll, 분자량: 1046.2 kDa
2) Substance P, 분자량: 1347.7 kDa
3) Insulin, 분자량: 5733.6 kDa
4) Cytochrome c, 분자량: 12,360.1 kDa
5) RNase A, 분자량: 13,682.2 kDa
6) Apo-Myoglobin, 분자량: 16,951.5 kDa
7) Trypsinogen, 분자량: 23,980.9 kDa