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PPSQ-53A protien seuqencer 장비 변경 안내

이전까지 N말단 서열 분석(edman sequencing 분석법) 시 이용한 protein sequencer 장비가 기존 API492 procise (appliedbiosystems, USA)모델에서 PPSQ-53A (Shimadzu, JAPAN)으로 변경 대체됨에 따라 관련 변경 사항을 미리 정리하여 N말단 서열 분석 의뢰자 분들에게 이해를 돕고자 합니다.

API492 procise

PPSQ-53A

분석 조건

유도체 반응 : edman degradation

(PITC / N-methylpiperidine)

Gradient : linear gradient elution

Detection : UVD 269nm

유도체 반응 : edman degradation

(PITC / Trimethylamine)

Gradient : isocratic elution

Detection : PDA 265-273nm

분석 순서

Initial STEP -> Blank -> PTH_STD -> Sample

∙ 별도 PTH_STD

Initial STEP -> 별도 Sample

데이터 분석

Dptu (reference) peak 기준 상대적인 용출 시간 (relative retention time)값 기분으로 peak assign

PTH-STD 의 개별 amino acid elution time (RT) 기준 calibration peak assign

분석법 특성

Cysteine 제외한 19개 아미노산 assign 가능

Cysteine 제외한 19개 아미노산 assign 가능

아미노산

검출 순서

D/N/S/Q/T/G/E/dmptu/A/H/Y/R/P/M/V/dptu /pmtc/W/dpu/F/I/K/L

D/E/dtt//N/Q/S/T/H/G/dmptu/A/Y/R/dth/ M/V/P/dptu /W/dpu/F/K/I/L

검출 감도

EPO (40ug)

initial peak intensity : 0~120mV

Collected sequence(15a.a) : APPRLIXDSRVLERY

initial peak intensity : 0~320mAU

Collected sequence(15a.a) : APPRLIXDSRVLERY

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