최근 화학자들이 새로운 방법을 이용해 얼마나 빨리 작은 분자들이 단백질 자체에 변화를 주거나 표지를 붙이지 않고 단백질에 결합하거나 결합하지 않는지를 파악할 수 있게 되었다(Anal. Chem. 2014, DOI: 10.1021/ac503391c). 연구자들은 이러한 정보를 이용해 타깃으로 하는 단백질과 복잡한 복합체의 형성을 가능하게 하는 능력을 지닌 잠재적인 의약품 후보군을 도출할 수 있게 되었다.

단백질과 작은 분자들의 복합체의 안정성은 얼마나 빨리 이들이 결합하고 해리되는지에 달려있다. 의약품 후보군과 효소 혹은 수용체들 간의 안정적인 복합체를 찾고자 하는 약화학자들은 빠르게 단백질에 결합하지만 이들에서 천천히 분리되는 작은 분자들을 찾고자 한다. 동화(association) 혹은 해리(dissociation) 상수를 측정하기 위한 몇몇 방법들은 분자들을 표면에 붙이고 다른 분자들 간의 결합을 모니터링하는 일을 필요로 한다. 하지만 이러한 방법은 관여하고 있는 단백질이나 분자의 표면을 변화시켜 실제와는 다른 형태의 결과를 얻을 수도 있다.

단백질이나 작은 분자들의 표면을 변화시키지 않고 속도 상수를 구하기 위해, 토론토 요크대(York University)의 Sergey N. Krylov와 동료 연구자들은 분자들을 크기에 따라 간단하게 분리할 수 있는 기술인 크기배제 크로마토그래피(size-exclusion chromatography)라는 기술을 이용했다. 이를 이용하면 크기가 큰 단백질들은 크로마토그래피의 컬럼을 통과해 빠른 속도로 이동하는 반면, 작은 분자들은 천천히 이동하게 된다. 이 새로운 방법에서, 연구자들은 자유 분자들로부터 복합체를 분리함으로써 시간에 따라 단백질-작은 분자 복합체 간의 분리를 추적할 수 있었다. (이하생략)

출처 : KISTI 미리안 『글로벌동향브리핑』

원본보기 : http://mirian.kisti.re.kr/futuremonitor/view.jsp?record_no=251804&cont_cd=GT